Būvniecība jaunās ēkas klostera Santa Clara Koimbrā tika uzsākta 1649. Old klosteris, celta beigās XIII gadsimtā, tika iznīcināta, un tika nolemts būvēt jaunu ēku par mūķenes ordeņa Santa Clara.

Projekts ir izstrādājusi benediktiešu mūks no klostera un karaļa arhitekts João Turriano, kas atbild par būvniecības karaļa arhitekta Mateus do Couto. New Construction ilga pietiekami ilgi. 1677 jauna ēka klosteris, kas kļuva pazīstams kā klostera Santa Clara-a-Nova, brauca mūķenes. In 1696 baznīca tika iesvētīta.

Galvenais portāls klostera baznīca ir dekorēts ar karaļa ģerbonis, kuru atbalsta divi eņģeļi. No baznīcas interjers ir baroka stilā. Baznīca ir viena nave, transept ir pazudis. Sānu kapelas un galvenā kapela ir dekorēts ar 14 svētbildes XVII gadsimta stilā "Talya dorado" - svētbildes kadrētas cirsts un apzeltīta koka. Turklāt jauna klosteris tika pārvietots kaps ar paliekām karalienes Izabellas Portugāles, dibinātājs klosteris. Pēc viņas vīra nāves, King Dinis, karaliene bija Coimbra klostera Santa Clara līdz pat savai nāvei, un tika apglabāts tur. Tāpēc, starp vietējiem šis klosteris sauc klosteris Queen Isabella. Kaps ar pelniem, kas izgatavoti no sudraba un kristāla, kas atrodas netālu no galvenās altāra baznīcas. Pirms baznīcas stāv piemineklis Queen Isabella, tēlnieka Antonio Teixeira Lopes XIX gs.

In 1733 klosterī klosterī tika uzcelta renesanses stilā. Šo galeriju, kas atbild par Ungārijas arhitekta Carlos Mardel celtniecība.