Nagasaki parādījās beigās XVI gadsimtā kā mazu ostas ciems, tad kļuva par pilsētu, ka nākamajos divarpus gadsimtus bija vienīgā osta atvērtas starptautiskajai tirdzniecībai. Līdz XVII gadsimtā Nagasaki kļuva par vienu no Japānas lielākais misionārs centriem, un tagad tas ir mājvieta lielāko kristiešu kopienu valstī.

Šie un citi fakti no pilsētas vēsturi var atrast, apmeklējot muzeju vēstures un kultūras Nagasaki. Tas tika atvērts 2005. gadā bijušajā dzīvesvietas kontrolē Nagasaki. Šī ēka pieder ēkām viduslaiku periodā, tas ir veikta pilnīga renovācija. Otrā pasaules kara laikā, šī ēka bija štābs gaisa aizstāvēt Nagasaki. Jo gaisa RAID pajumte, kas atrodas rietumu daļā ēkas brīdī atomu bombardēšanas pilsētnieku meklēja patvērumu.

Muzeja kolekcijā ir 48000 preces, ieskaitot dokumentus, darbu mākslas un amatniecības, kā arī priekšmetus, kas celta uz Japānu ārvalstu tirgotāju. Ekspozīcija muzeja lielā mērā veltīts tēmai starptautisko attiecību un kontaktu ar citām valstīm, Japānu tās izolāciju laikā, kas aptver XVII XIX gs. Jo īpaši pastāvīgā ekspozīcija iepazīstina eksponātus celta no Holandes, Korejas un Ķīnas. Muzejā var arī iegūt priekšstatu par tā saucamo kultūru vai kultūras Nanban "Dienvidu barbariem" - imigranti no Portugāles un Spānijas. Arī daļa no muzeja krājuma ir veltīta ieviešanu un izplatīšanos kristietību.

Muzeja telpu ir sadalīts trīs daļās, viens no tiem ir piešķirts ar tēmu un satur Nagasaki miertiesnesis rekonstrukciju dzīves amatpersonu viduslaikos. Pārējās divas daļas ir veltītas vēsturisko kultūru un mūsdienu dzīves Nagasaki - uz vietu pilsētas valsts ekonomikā un publiskajā sfērā ir līderis.