Arheoloģijas muzejs Agios Nikolaos atrodas uz ziemeļiem no ezera Voulismeni ielas Paleologos, 74, dažu minūšu gājiena attālumā no pilsētas centra. Muzejs tika dibināts 1970.gadā, un ir bagāta kolekcija arheoloģisko atradumu prefektūras Lasithi.

Muzeja ekspozīcija ir ievietots astoņās izstāžu zālēs un aptver milzīgu periodu vēsturi no neolīta līdz romiešu laikmeta. Muzeja kolekcijā ir keramikas, akmens skulptūras, statujas, mājsaimniecības piederumi, dažādas bēru artefaktu, zelta rotaslietas, bronzas un ziloņkaula artefaktus no retas bērnu apbedīšanas un vairāk.

Visvairāk iespaidīgs eksponāts muzejs ir galvaskauss jauneklis atrodamas Romas kapsētā Potamos netālu no pilsētas. Galvaskauss aizsākās 1 gadsimta AD un vainagojušies ar zelta diadēmas veidā olīvu lapu. Mutē galvaskausa bija sudraba monēta no Polirinia (West Crete), atbrīvošana, kas ir datēta ar valdīšanas Romas imperatora Tibērija valdīšanas. Monēta, saskaņā ar senu tradīciju, pārvadātājs bija jāmaksā Charon dvēseles pazemes elles pāri upei Styx.

Īpaši interesanti ir atklāto izrakumos Minoan kapos Aghia Fotia laikā artefakti. Tas ir aizvēsturiska kapi, kas tika atrasts 260 Minoan kapenes, ir vieta no lielākajām arheoloģisko izrakumu vietām Krētā. Dibināta šeit 1600 dažādu kuģu veikti, neizmantojot podnieka ratu un viņa stils ir līdzīgs Kiklādu mākslu.

Prezentēts muzeju un artefaktu no Minoan norēķiniem Myrtos, kuru vidū vissvarīgākais tiek uzskatīts par "dieviete Myrtos" - kuģa formā sievietes figūra. Muzejs arī eksponāti artefaktus no Minoan Malijas pils, tostarp lielisku akmens kuģu izlietnes veidā Triton.

Arheoloģijas muzejs Agios Nikolaos ir viens no svarīgākajiem muzejiem Krētas.