Ben Ezra sinagoga arhitektūra neatšķiras no standarta arhitektūru koptu baznīcām. Tas notika tāpēc, ka ēka sākotnēji bija baznīca, bet beigās X gadsimtā. Kalifs Hakim slēdza baznīcu. Vairāk pēdējā laikā ēka ir izpirkti ebreju kopiena, kas tolaik bija ievērojama daļa no Ēģiptes sabiedrībā. Sinagoga tika nosaukts pēc Rabbi Abraham ben Ezra Jeruzalemē.

Famous sinagoga, ka XIX gadsimtā, renovācijas laikā tika atklāts krātuvi dokumentus ar tūkstošiem XI-XII gs.
Nesen atjaunota sinagogu.